Google DeepMindがAlphaGenome 2を発表：DNA細胞を読み取り、変異の識別能力がほぼ倍増

金融情報アプリJitongo Finance APPによると、Alphabet（GOOGL.US）傘下のAI部門DeepMindは水曜日、最新のAIモデル「AlphaGenome 2」を発表した。このモデルはDNA細胞の解読を目的としている。

DeepMindはブログ記事で、「さまざまな組織全体の平均から単一細胞タイプや細胞の状態まで深く解析し、モデルのアーキテクチャを再設計することで、AlphaGenome 2は変異予測性能において飛躍的な向上を達成しました」と述べた。また、「重要なのは、研究者が従来の広範な組織モデルでは見過ごされた疾患関連細胞内の変異効果を予測できるようになったこと、さらにモデルがこれまで扱ったことのない細胞状態や疾患状態も予測できることです。従来の最先端モデルと比べ、AlphaGenome 2が特定した細胞内の遺伝子発現を変化させる変異の数はほぼ2倍に上ります。」と続けている。

DeepMindはさらに、AlphaGenome 2は68種類の組織、1億以上の単一細胞マップでトレーニングされていると述べた。そのため、静的な細胞マップを遺伝学的な予測エンジンに変換することが可能となっている。

「元のモデルが組織全体の平均値に依存していたのを超えて、AlphaGenome 2は特定の細胞内の活動、例えば特定の心筋細胞や血液免疫細胞内の活動も解析できることで、特定の細胞タイプでのみ機能する重要なDNA変異の発見にも寄与します」とDeepMindは補足した。

この新しいAIモデルは、前世代モデルに比べて複数の面で改良が加えられており、特定細胞内での遺伝子制御の予測、変異効果の予測能力の向上、病気関連変異の正確な特定などが含まれる。同社は最近の研究を引用し、「制御スイッチが腸管免疫細胞でETS2遺伝子を過剰活性化することで炎症性腸疾患が引き起こされる」ことを示しており、AlphaGenome 2は計算レベルでこの発見を再現できるとしている。

AlphaGenome 2は現在、AlphaGenome API経由で非商用研究向けに提供されており、商用研究者にはプライベートプレビュー版が公開されている。