Google (GOOGL.US) DeepMind publie AlphaGenome 2 : capable de lire les cellules d'ADN, avec une capacité de détection des variations presque doublée
Google DeepMind a publié le modèle d'IA AlphaGenome 2, entraîné sur plus de 100 millions de cartes cellulaires, dont la capacité à identifier les variations d'expression génétique est presque deux fois supérieure à celle de la génération précédente.
Selon les informations de Jinse Finance, DeepMind, le département d'intelligence artificielle d'Alphabet (GOOGL.US), a publié mercredi son dernier modèle d'IA, AlphaGenome 2, conçu pour interpréter les cellules d'ADN.
DeepMind a écrit dans un article de blog : « En passant d'une moyenne généralisée entre divers tissus à l'analyse approfondie de types et d'états cellulaires précis, et en révisant l'architecture du modèle, AlphaGenome 2 a réalisé une avancée significative en matière de performance dans la prédiction des variations », « Il est particulièrement important qu'il permette désormais aux chercheurs de prévoir les effets des variations dans des cellules liées à certaines maladies qui pourraient être ignorées par des modèles traditionnels, ainsi que de prédire des états cellulaires et pathologiques encore jamais observés par le modèle. Par rapport à la version précédente, AlphaGenome 2 identifie près de deux fois plus de variations qui modifient l'expression génétique à l'intérieur des cellules. »
DeepMind indique en outre qu'AlphaGenome 2 a été entraîné sur 68 tissus et plus de 100 millions de cartes unicellulaires. De ce fait, il peut transformer des cartes cellulaires statiques en un véritable moteur de prédiction génétique.
« En dépassant la simple dépendance du modèle originel à la moyenne globale des tissus, AlphaGenome 2 parvient à analyser l'activité au sein de cellules spécialisées—par exemple des cellules cardiaques spécifiques ou des cellules immunitaires sanguines—ce qui aide à découvrir des variations clés de l'ADN avec un effet confiné à des types cellulaires particuliers », ajoute DeepMind.
Ce nouveau modèle d'IA améliore son prédécesseur sur plusieurs plans, notamment la prédiction de la régulation génétique dans certaines cellules, le renforcement de la capacité à prévoir les effets des variations, ainsi que la localisation plus précise des variations liées à des maladies. Selon une étude récente citée par l'entreprise, un interrupteur régulateur favorise l’activation excessive du gène ETS2 dans les cellules immunitaires intestinales, provoquant des maladies inflammatoires de l'intestin—une découverte qu'AlphaGenome 2 parvient à reproduire à l’échelle computationnelle.
AlphaGenome 2 est désormais accessible via l’API AlphaGenome pour la recherche non commerciale, et disponible en préversion privée pour les projets de recherche commerciale.
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